При микрокапсулировании экструзией предварительно на поверхности с отверстиями малого диаметра формируется тонкая вязкая пленка из пленкообразующего материала, сквозь которую продавливается капсулируемое вещество. Сформированная таким образом оболочка далее стабилизируется охлаждением или полимеризацией входящих в ее состав мономеров.
Для микрокапсулирования методом экструзии используют также формующие устройства, представляющие собой две коаксиально расположенные трубки различных диаметров (устройство «труба в трубе»). Во внутреннее отверстие трубки под давлением подают капсулируемый материал, а в межтрубное пространство — материал оболочки. Толщину оболочки в этом случае регулируют изменением зазора между отверстиями трубок путем поднятия или опускания внутренней трубки. Обрыв капли может происходить в результате срезания капли вибрирующей пластинкой, открывающей выходное отверстие с определенной частотой под воздействием высокочастотных колебаний и других внешних воздействий. Каждая отдельная капсула состоит из ядра (затемнение в центре) и полупрозрачной оболочки. Можно увидеть, что в зависимости от скорости подачи и соотношений капсулируемого материала и материала оболочки меняется морфология микрокапсул — при увеличении скорости подачи капсулируемого материала и снижении скорости подачи материала оболочки объем ядра увеличивается, а толщина оболочки снижается. Стоит отметить, что при увеличении расхода любой из фаз требуется повышение частоты колебаний для формирования микрокапсул того же размера. Методом экструзии, например, капсулируют различные витамины. В этом случае во внутреннее отверстие формующего устройства подают вазелиновое масло, содержащее витамины. Материалом оболочек служит желатин, нагретый водный раствор которого подают в межтрубное пространство. Вазелиновое масло проходит через отверстие внутренней трубки, попадает в слой раствора желатина, обволакивается пленкой и поступает в окружающую среду с температурой около 5 °С для «застывания» оболочки.
Иногда метод экструзии сочетают с поликонденсацией на границе раздела фаз, принтом получают двойные оболочки.
Преимущества методов экструзии: однородность получаемых микрокапсул, высокая производительность, широкий спектр возможных капсулируемых веществ и пленкообразующих материалов.